本发明公开了RSB11优异等位变异RSB11‑R及其在改良水稻纹枯病抗性中的应用。本发明提供了一种DNA分子，其核苷酸序列如SEQ ID No.4所示。该DNA分子为水稻中优异自然等位变异RSB11‑R的启动子。将该RSB11优异等位变异RSB11‑R转入常规粳稻品种中，可以得到纹枯病抗性显著增强的改良水稻植株。
本发明公开了水稻RSB11基因在抗纹枯病中的应用。本发明提供了RSB11蛋白在调控植物纹枯病抗性中的应用；所述RSB11蛋白为SEQ ID No.1所示蛋白或其经一个或几个氨基酸残基的取代和/或缺失和/或添加，或序列具有99％以上、95％以上、90％以上本发明的抗纹枯病基因RSB11正向调控水稻纹枯病抗性。过表达该基因可增强水稻对纹枯病的抗性，将所述基因的优异自然等位变异RSB11‑R转入常规粳稻品种中，也可以得到纹枯病抗性显著增强的改良水稻植株。
